Treća grupa humanih hormona su proteini, peptidni hormoni koji nastaju iz amino kiselina. Neki od peptidnih hormona su kalcitonin, vazopresin, gonadotropin, hormon rasta, leptin, insulin, motilin, sekretin, renin, prolaktin, oksitocin i dr. Peptidni hormoni regulišu veliki broj funkcija u organizmu.